Luận Văn Xây dựng qui trình PCR phát hiện nấm Ustilago scitaminea gây bệnh than trên mía

TÓM TẮT KHÓA LUẬN
Hồ Bửu Thông, Đại học Nông Lâm Tp. Hồ Chí Minh. Tháng 8 / 2007. “Xây dựng qui trình PCR phát hiện nấm Ustilago scitaminea gây bệnh than trên mía.” đề tài được thực hiện từ tháng 5 đến tháng 8 năm 2007 tại Trung tâm Phân tích Thí nghiệm Hoá Sinh thuộc Viện Nghiên cứu Công nghệ Sinh học và Công nghệ Môi trường, Trường Đại học Nông Lâm Thành phố Hồ Chí Minh.
Giáo viên hướng dẫn: PGS. TS. Bùi Cách Tuyến.
Nội dung nghiên cứu
 Nuôi cấy, phân lập, tách đơn bào tử và nhân sinh khối nấm Ustilago scitaminea.
 Xây dựng qui trình PCR phát hiện trực tiếp DNA sợi nấm Ustilago scitaminea.
Kết quả đạt được
 Phân lập, tách đơn bào tử và nhân sinh khối 11 dòng nấm Ustilago scitaminea từ 11 giống mía khác nhau ở Bình Dương.
 Xây dựng được qui trình PCR phù hợp với điều kiện phòng thí nghiệm để phát hiện nấm Ustilago scitaminea.
Chương 1: MỞ ĐẦU1
1.1. Cơ sở tiến hành và ý nghĩa của nghiên cứu 1
1.2. Nội dung nghiên cứu 2
1.3. Yêu cầu 2
1.4. Giới hạn đề tài 2
Chương 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 3
2.1. Sơ lược về cây mía 3
2.1.1. Lịch sử phát hiện 3
2.1.2. Phân loại 3
2.1.3. Nguồn gốc và phân bố 4
2.1.4. Nhân giống 5
2.1.5. Sản lượng 5
2.1.6. Chế biến và sử dụng 5
2.1.7. Vị trí kinh tế của cây mía 6
2.1.8. Sản xuất protein tái tổ hợp từ mía 7
2.1.9. Bệnh trên cây mía 7
2.2. Bệnh than 8
2.2.1. Nguồn gốc và phân bố 8
2.2.2. Triệu chứng 9
2.2.3. Tác nhân gây bệnh 9
2.2.4. Đặc điểm phát sinh phát triển bệnh 10
2.2.5. Thiệt hại về kinh tế 11
2.2.6. Biện pháp phòng trừ 11
2.3. Các phương pháp xác định bệnh than 11
2.3.1. Dựa vào triệu chứng 11
2.3.2. Phương pháp chẩn đoán bằng cách nhuộm mắt mầm và soi dưới kính hiển vi huỳnh quang. 12
2.3.3. Phương pháp ELISA 12
2.3.4. Phương pháp PCR 12
2.4. Tình hình nghiên cứu bệnh than 21
2.4.1. Trên thế giới 21
2.4.2. Trong nước 23
Chương 3: VẬT LIỆU VÀ PHưƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 24
3.1. Nội dung nghiên cứu 24
3.2. Thời gian và địa điểm nghiên cứu 24
3.3. Vật liệu nghiên cứu 24
3.4. Phương pháp tiến hành 24
3.4.1. Phương pháp lấy mẫu 24
3.4.2. Phương pháp phân lập 25
3.4.3. Phương pháp tách đơn bào tử 25
3.4.4. Phương pháp nhân sinh khối nấm 26
3.4.5. Phương pháp ly trích DNA tổng số của nấm Ustilago scitaminea 26
3.4.6. Tinh sạch sản phẩm ly trích 28
3.4.7. Phương pháp PCR phát hiện nấm Ustilago scitaminea 29
Chương 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 32
4.1. Phân lập, tách đơn bào tử và nhân sinh khối nấm Ustilago scitaminea 32
4.1.1. Kết quả phân lập 32
4.1.2. Kết quả tách đơn bào tử 33
4.1.3. Kết quả nhân sinh khối 34
4.2. Kết quả ly trích và tinh sạch DNA sợi nấm 36
4.2.1. Kết quả ly trích 36
4.2.2. Kết quả tinh sạch 37
4.3. Phát hiện DNA của Ustilago scitaminea bằng kỹ thuật PCR 39
Chương 5: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 43
5.1. Kết luận43
5.2. Đề nghị 43
TÀI LIỆU THAM KHẢO 44
PHỤ LỤC 47