Luận Văn ứng dụng phương pháp pcr phát hiện vi khuẩn aeromonas hydrophila phân lập từ cá tra (pangasianodon h

ĐỀ TÀI: ỨNG DỤNG PHƯƠNG PHÁP PCR PHÁT HIỆN VI KHUẨN Aeromonas hydrophila PHÂN LẬP TỪ CÁ TRA (Pangasianodon hypophthamus) BỊ BỆNH XUẤT HUYẾT



MỤC LỤC​Chương 1: GIỚI THIỆU . 1

Chương 2: LƯỢC KHẢO TÀI LIỆU 3

2.1 Tình hình nuôi thủy sản ở Việt Nam . 3

2.2 Nguyên nhân và tình hình dịch bệnh thủy sản . 3

2.3 Các thời kỳ phát triển của bệnh . 4

2.4 Sơ lược về bệnh ở cá tra 5

2.5 Sơ lược về vi khuẩn A. hydrophila gây bệnh trên cá tra 7

2.6 Phương pháp PCR 9

2.6.1 Khái niệm về PCR . 9

2.6.2 Các nhân tố ảnh hưởng tới phản ứng PCR . 11

2.6.3 Ứng dụng của kỹ thuật PCR trong thủy sản . 12

2.6.4 Đối chứng 13

2.6.5 Hạn chế của PCR 13

Chương 3: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 15

3.1 Thời gian và địa điểm nghiên cứu . 15

3.1.1 Thời gian . 15

3.1.2 Địa điểm 15

3.1.3 Nội dung thực hiện 15

3.2 Vật liệu nghiên cứu 15

3.2.1 Thiết bị - Dụng cụ . 15

3.2.2 Hóa chất thí nghiệm 16

3.3 Phương pháp nghiên cứu 16

3.3.1 Thu mẫu, bảo quản và vận chuyển . 16

3.3.2 Nguồn vi khuẩn . 16

3.3.3 Phương pháp phân lập vi khuẩn . 17

3.3.4 Phương pháp phục hồi và nuôi tăng sinh vi khuẩn . 18

3.3.5 Phương pháp PCR 18

3.3.6 Thí nghiệm xác định độ nhạy của qui trình PCR 20

3.3.7 Thí nghiệm xác định tính đặc hiệu của qui trình PCR . 21

Chương 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN . 22

4.1 Kết quả phân lập vi khuẩn A. hytrophila trên cá tra bị bệnh xuất huyết . 22

4.2 Kết quả phục hồi vi khuẩn 23

4.3 Phát hiện vi khuẩn A. hydrophila bằng phương pháp PCR 24

4.4 Độ nhạy của phương pháp PCR phát hiện A. hydrophila. . 26

4.5 Tính đặc hiệu của phương pháp PCR phát hiện A. hydrophila. 27

Chương 5: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ XUẤT 30

5.1 Kết luận 30

5.2 Đề xuất . 30

TÀI LIỆU THAM KHẢO 31

PHỤ LỤC 1 34

PHỤ LỤC 2 35

PHỤ LỤC 3 37