Luận Văn Ứng dụng phương pháp PCR Genotyping trong nghiên cứu tác nhân gây bệnh đốm trắng (WSSV) trên tôm sú

Đề tài: Ứng dụng phương pháp PCR Genotyping trong nghiên cứu tác nhân gây bệnh đốm trắng (WSSV) trên tôm sú


Luận văn dài 51 trang

Chương I - GIỚI THIỆU 1

Chương II - LƯỢC KHẢO TÀI LIỆU 3
2.1 Tình hình bệnh đốm trắng trên tôm 3
2.1.1 Trên thế giới 3
2.1.2 Ở Việt Nam . 4
2.2 Một số vấn đề liên quan đến virus gây đốm trắng - WSSV 5
2.2.1 Hình thái học của WSSV . 5
2.2.2 Cấu trúc protein . 5
2.2.3 Gen và phân loai học 6
2.2.4 Sự biến đổi về gen và độc lực của các dòng virus . 7
2.2.5 Vật chủ cảm nhiễm 7
2.2.6 Một số nghiên cứu về tác nhân gây bệnh đốm trắng bằng
kỹ thuật PCR - genotyping . 8
2.3 Phương pháp chẩn đoán PCR 9
2.3.1 Nguyên tắc phản ứng PCR . 9
2.3.2 Một số yếu tố chính ảnh hưởng đến phản ứng PCR 9
2.3.3 Úng dụng của kỹ thuật PCR . 10


Chương III - VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU . 11
3.1 Địa điểm và thời gian nghiên cứu 11
3.2 Vật liệu nghiên cứu . 11
3.2.1 Dụng cụ và hoá chất 11
3.2.2 Vật liệu nghiên cứu 11
3.3 Phương pháp nghiên cứu . 12
3.3.1 Phương pháp Nested - PCR phát hiện WSSV . 12
3.3.2 Phương pháp PCR-genotyping . 14
Chương IV - KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN . 16
4.1 Phân tích mẫu thu năm 2008 16
4.1.1 Kết quả phân tích PCR-WSSV-IQ2000 16
4.1.2 Kết quả phân tích PCR-Genotyping . 19
4.1.2.1 Kết quả phân tích PCR-Genotyping thuộc ORF94 19
4.1.2.2 Kết quả phân tích PCR-Genotyping thuộc ORF125 25
4.2 Kết quả phân tích mẫu axit nucleic trử năm 2006 với PCR-Genotyping
thuộc ORF125 30
4.3 So sánh sự khác nhau về số vùng lặp lại thuộc ORF94 ở Cà Mau
và Bạc Liêu vào năm 2006 và 2008 . 33
4.4 So sánh sự khác nhau về số vùng lặp lại thuộc ORF125 ở Cà Mau
và Bạc Liêu vào năm 2006 và 2008 . 35


Chương IV - KẾT LUẬN VÀ ĐỀ XUẤT . 38
4.1 Kết luận . 38
4.2 Đề xuất 38


TÀI LIỆU THAM KHẢO 39
PHỤ LỤC I 42
PHỤ LỤC II . 43