Luận Văn Sử dụng chỉ thị phân tử Microsatellite đánh giá đa dạng di truyền các dòng keo lá tràm (Acacia auric

Sử dụng chỉ thị phân tử Microsatellite đánh giá đa dạng di truyền các dòng keo lá tràm (Acacia auriculiformis)

Mục Lục

Phần 1. MỞ ĐẦU . 1

1.1 Đặt vấn đề 1
1.2 Yêu cầu và mục đích nghiên cứu của đề tài . 2
1.4 Giới hạn của đề tài . 2

Phần 2. TỔNG QUAN . 4

2.1 Giới thiệu về đa dạng sinh học . 4
2.1.1 Định nghĩa . 4
2.1.2 Ý nghĩa của đa dạng sinh học . 4
2.1.3 Các phân mức về đa dạng sinh học . 4
2.1.3.1 Sự đa dạng về hệ sinh thái 4
2.1.3.2 Đa dạng loài . 5
2.1.3.3 Đa dạng về di truyền 6
2.2 Một số DNA marker sử dụng nghiên cứu sự đa dạng di truyền 7
2.2.1 Phân loại 7
2.2.2 Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) . 8
2.2.3 Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) . 9
2.2.4 Kỹ thuật RAPD (Random Amplified Polymorphism DNA) 10
2.2.5 SSR (Microsatellite) 10
2.3 Kỹ thuật Microsatellite . 11
2.3.1 Khái niệm về Microsatellite 11
2.3.2 Tính chất 12
2.3.3 Sự phát triển của primer Microsatellite . 13
2.3.4 Giới hạn của Microsatellite . 14
2.3.5 Các loại Microsatellite 15
2.3.6 Cơ chế hình thành và vai trò của Microsatellite . 15
2.3.6.1 Cơ chế hình thành Microsatellite 15
2.3.6.2 Vai trò của Microsatellite . 17
2.3.7 Các phương pháp phát hiện Microsatellite . 18
2.3.7.1 Phương pháp lai . 18
2.3.7.2 Phương pháp PCR 19
2.4 Polymerase Chain Reaction (PCR) 19
2.4.1 Khái niệm 19
2.4.2 Thành phần và vai trò của các chất trong phản ứng PCR . 20
2.4.4 Ứng dụng của kỹ thuật PCR 23
2.4.5 ưu và nhược điểm của kỹ thuật PCR 23
2.5 Quy trình ly trích DNA thực vật 23
2.5.1 Định lượng DNA bằng phương pháp quang phổ 25
2.5.2 Định tính DNA ly trích bằng phương pháp điện di 26
2.6 Tổng quan về cây Keo lá tràm (Acacia auriculiformis) 28
2.6.1 Vài nét về chi Keo (Acacia) 28
2.6.1.1 Đặc điểm sinh học của các loài Keo 28
2.6.1.2 Công dụng của các loài Keo (Acacia) 30
2.6.2 Vài nét về cây Keo lá tràm (Acacia auriculiformis A. Cunn ex Benth) 32
2.6.2.1 Các đặc điểm sinh học và sinh thái 33
2.6.2.2 Công dụng và tiềm năng gây trồng 35

Phần 3. VẬT LIỆU VÀ PHưƠNG PHÁP . 36

3.1 Thời gian và địa điểm thực hiện . 36
3.1.1 Thời gian thực hiện . 36
3.1.2 Địa điểm thực hiện . 36
3.2 Vật liệu thí nghiệm . 36
3.3 Phương pháp thí nghiệm 36
3.4 Thiết bị và dụng cụ . 37
3.5 Ly trích DNA . 37
3.5.1 Hóa chất . 37
3.5.2 Quy trình ly trích DNA . 38
3.5.3 Kiểm tra sản phẩm DNA ly trích . 40
3.6.1 Qui trình phản ứng PCR 40
3.6.2 Điện di sản phẩm PCR 42

Phần 4. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 44

4.1 Quá trình ly trích . 44
4.2 Phản ứng PCR 44

Phần 5. KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ . 48

5.1 Kết luận 48
5.2 Đề nghị . 48
TÀI LIỆU THAM KHẢO 50
PHỤ LỤC