Thạc Sĩ Phân tích mối quan hệ di truyền tập đoàn giống cây chò chỉ bằng chỉ thị rapd và chỉ thị lục lạpcpSSR

TÓM TẮT Mười sáu mồi RAPD và 06 cặp mồi cpSSR đã được sử dụng để phân tích đa dạng di truyền DNA của 18 mẫu Chò chỉ thu được ở Phú Thọ, Thanh Hóa, Ninh Bình và Tuyên Quang. Trong số 16 mồi RAPD dùng để phân tích có 12/16 mồi chỉ ra tính đa hình với giá trị PIC (Polymirphic Information Content - hàm lượng thông tin đa hình) dao động từ 0 (mồi OPA04, OPN11) đến 0,524 (mồi OPQ04). Số lượng các phân đoạn DNA nhân bản với mỗi mồi xê dịch từ 1 đến 9 phân đoạn, đa dạng về kích thước từ 300 bp đến 2000 bp. Tổng số có 72 phân đoạn DNA được nhân bản, có 44 phân đoạn đa hình (chiếm 39,2%). Hệ số tương đồng di truyền giữa 18 mẫu Chò chỉ dao động từ 0,507 (giữa mẫu TH6 và TQ18) đến 0,986 (giữa mẫu TH8 và TH10, TQ19 và 1Q20). Biểu đồ hình cây về hệ số di truyền giữa 18 mẫu nghiên cứu được chia thành 2 nhánh chính. Nhánh chính I có duy nhất mẫu TH6 có hệ số sai khác di truyền với các mẫu còn lại là 41,9%. Nhánh chính II gồm 17 mẫu còn lại có hệ số sai khác di truyền trong khoảng 1,4% đến 23,5% và được chia làm 2 nhánh phụ. Trong số 9 cặp mồi cpSSR dùng để phân tích có 6/9 cặp mồi đã nhân bản được sản phẩm PCR nhưng chỉ có duy nhất cặp mồi Dal2-F - Dal2-R chỉ ra tính đa hình. Chín enzyme cắt hạn chế được dùng để đánh giá đa hình sản phẩm PCR. Tuy nhiên, kết quả cắt hạn chế sản phẩm PCR đã không chỉ ra tính đa hình.