Báo Cáo Nghiên cứu giải mã vùng gen vp1 của một số mẫu vacxin viêm gan vịt hiện đang sử dụng tại việt nam

NGHIÊN CỨU GIẢI MÃ VÙNG GEN VP1 CỦA MỘT SỐ

MẪU VACXIN VIÊM GAN VỊT HIỆN ĐANG SỬ DỤNG TẠI

VIỆT NAM

STUDY ON GENETIC PROPERTIES OF THE ANTIGENIC VP1 GENE OF

THE TWO ATTENUATED VACCINE VIRUS SAMPLES OF DUCK HEPATITIS

CURRENTLY USED IN VIETNAM



SVTH: NGUYỄN THỊ DIỄM QUỲNH

Lớp: 03 SH, Trường Đại học Bách khoa

GVHD: PGS. TS. LÊ THANH HÒA

Phòng Miễn dịch học-Viện Công nghệ Sinh học-Viện Khoa học

và Công nghệ Việt Nam


TÓM TẮT

Viêm gan vịt là một bệnh truyền nhiễm xảy ra ở thể cấp tính đối với vịt con. Trong hệ gen của

virus viêm gan vịt, gen kháng nguyên VP1 - vừa quyết định tính kháng nguyên, vừa quyết tính

độc lực của virus. Trong đề tài này, toàn bộ gen VP1 có độ dài 714 bp đã được thu nhận từ

hai chủng vacxin nghiên cứu: i) chủng vacxin xưởng thuốc (kí hiệu là VxXT), ii) chủng vacxin

Ai Cập (kí hiệu là VxAC). Với chương trình BLAST, tiến hành truy cập Ngân hàng gen sử dụng

chuỗi gen kháng nguyên VP1 của hai mẫu nghiên cứu trên, chúng tôi nhận thấy rằng gen VP1

của mẫu VxAC có độ tương đồng cao với các chủng virus viêm gan vịt type 1 (DHV1) của thế

giới. Bằng phương pháp phân tích phả hệ cho thấy: Chủng vacxin Ai Cập có thể có nguồn gốc

từ Trung Quốc, còn chủng vacxin xưởng thuốc mặc dù vẫn nằm trong nhánh các chủng của

Trung Quốc nhưng có quan hệ xa hơn so với chủng vacxin Ai Câp, và có thể có nguồn gốc từ

một chủng cổ điển của Hàn Quốc.


ABSTRACT

Duck hepatitis virus (DHV) is an acute and fatal disease of young ducklings characterized by

its rapid transmission. In the genome of Duck hepatitis virus type 1 (DHV1), the VP1 antigenic

gene affects to the antigenic and virulent of hepatitis virus. The complete 714 bp VP1

sequence was obtained from the two samples of attenuated vaccine: i) a vaccine strain from

VETVACO (designated as VxXT); ii) a vaccine strain from Egypt (designated as VxAC) strains

(Egyptian vaccine). Using the VP1 sequence of each strain as an entry to search at BLAST, it

revealed that our VP1 of VxAC has high identity to DHV1 of world strains. Phylogenetic

analysis confirmed the Chinese origin of VxAC and Korean origin of VxXT. The VxXT strain,

although belongs to the group of other Chinese strains, has more distant relation than the

Egyptian vaccine (VxAC) strain, possibly it has been originated from a classical strain of Korea.