Luận Văn áp dụng phương pháp vntr - miru định kiểu gene các chủng micobacterium tuberculosis phân lập tại việ

ÁP DỤNG PHƯƠNG PHÁP VNTR - MIRU ĐỊNH KIỂU GENE CÁC CHỦNG MICOBACTERIUM TUBERCULOSIS PHÂN LẬP TẠI VIỆT NAM


NGUYỄN THỊ HỒNG DUYÊN​

Trang nhan đề
Lời cảm ơn
Mục lục
Danh mục
Lời mở đầu

Phần 1: Tổng quan tài liệu

Phần 2: Vật liệu và phương pháp

Phần 3: Kết quả

Phần 4: Thảo luận

Phần 5: Kết quả và đề nghị

Tài liệu tham khảo
Phụ lục

MỤC LỤC
Trang
Lời cảm ơn
Mục lục
Danh mục bảng
Danh mục hình
Danh mục chữ viết tắt
Lời mở đầu
Mục tiêu đề tài
Tính cấp thiết, ý nghĩa lí luận và thực tiễn của đề tài
1. Tổng quan tài liệu
1.1. Bệnh lao
1.1.1. Bệnh lao xét ở mức độ toàn cầu và ở Việt Nam
1.1.1.1. Gánh nặng bệnh lao trên thế giới
1.1.1.2. Gánh nặng bệnh lao ở Việt Nam
1.1.2. Phân loại bệnh lao
1.1.2.1. Lao phổi AFB(+)
1.1.2.2. Lao phổi AFB (-)
1.1.2.3. Lao ngoài phổi
1.1.3. Phân loại và đặc điểm vi khuẩn lao
1.1.3.1. Phân loại
1.1.3.2. Các đặc điểm sinh học cơ bản của mycobacteria
1.1.4. Bộ gene vi khuẩn lao
1.1.4.1. Cấu trúc bộ gene vi khuẩn lao
1.1.4.2. Cơ chế tiến hoá chung của vi khuẩn lao và chiến lược xuất hiện đa
dạng di truyền của vi khuẩn lao
1.2. Các kĩ thuật sinh học phân tử xác định kiểu gene vi khuẩn lao
1.2.1. Các kĩ thuật sinh học phân tử phổ biến hiện nay trong tình hình nghiên
cứu tại Việt Nam
1.2.2. Kĩ thuật dựa trên Variable Number of Tandem Repeats – Mycobacterial
Interspersed Repetitive Unit
1.2.3. Các thông số chung để đánh giá và kiểm định phương pháp định kiểu
gene
1.2.3.1. Khả năng thực hiện
1.2.3.2. Sự tiện lợi
1.3. Nghiên cứu dịch tễ phân tử trên M.tuberculosis (đặc biệt kiểu gene Beijing)
1.3.1. Những đặc điểm di truyền xác định M.tuberculosis họ Beijing
1.3.2. Dịch tễ học họ Beijing
1.3.3. Những kết quả ban đầu trong nghiên cứu lâm sàng họ Beijing
2. Vật liệu và phương pháp
2.1. Đối tượng nghiên cứu . 29
2.2. Kỹ thuật sinh học phân tử xác định kiểu gene dựa trên VNTR – MIRU
2.2.1. Khuếch đại trình tự đích
2.2.1.1. Nguyên tắc
2.2.1.2. Tiến hành
2.2.2. Điện di mao quản
2.2.3. Xử lí thông tin thu nhận được
3. Kết quả
3.1. Tối ưu hóa một số điều kiện phản ứng trong phương pháp VNTR –
MIRU định kiểu gene các chủng Mycobacterium tuberculosis phân lập tại
Việt Nam
3.2. Đánh giá mức độ áp dụng của kỹ thuật định kiểu gene dựa trên VNTRMIRU
3.2.1. Khả năng định kiểu gene (Typability)
3.2.2. Độ lặp lại của kỹ thuật (Reproducibility)
3.2.3. Allelic diversity: Chỉ số phân biệt để tính độ đa dạng kiểu gene dựa trên
từng vị trí VNTR
3.2.4. Độ phân giải của kỹ thuật (Discriminatory power)
4. Thảo luận
4.1. Áp dụng phương pháp VNTR – MIRU
4.2. Tính ổn định của phương pháp
4.3. Giá trị của phương pháp trong bối cảnh dịch tễ, lâm sàng
5. Kết luận và Đề nghị
Danh mục công trình tác giả
Tài liệu tham khảo
Phụ lục